L’attività è incentrata sulla determinazione della biodiversità vegetale e dei microrganismi nel suolo e nelle piante in contesti naturali ed antropici. Per individuare e quantificare i taxa vegetali presenti, soprattutto in sistemi erbacei, sono utilizzati metodi di rilievo classici (determinazione di specie vegetali mediante chiavi morfologiche, indici di diversità, di ricchezza, di dominanza, di equitabilità, distribuzione delle abbondanze, analisi floristica, spettri biologici, corologici, Strategie di Grime). Per la determinazione dei taxa batterici e fungini il laboratorio si avvale del metabarcoding delle regioni 16S e ITS in campioni di suolo e vegetali (epifiti/endofiti). Sia per la biodiversità vegetale che microbica l’attività prevede il calcolo dei classici indici di Shannon, evenness e Simpson in relazione alla ricchezza e ai gruppi funzionali.
Strumentazione di rilievo
- Fluorimetro a piastre Infinite F200 pro
- TECAN
- Fluorimetero Qubit 4, Thermo Fisher
- PCR, Eppendorf
- Stazione per elettroforesi
- Centrifughe
- Agitatori orizzontali
Responsabile Scientifico | Francesca Bretzel, Silvia Traversari |
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Team | Serena Doni, Valerio Lazzeri, Francesca Vannucchi |
Contatti | E-mail: francesca.bretzel@cnr.it, silvia.traversari@cnr.it |